Tuy nhiên, mức điều chỉnh giảm cũng chỉ tương đương với số lượng đã tuyển sinh của năm học trước. Khối ngành và trường giảm chỉ tiêu mạnh là hệ đại học Sư phạm từ 1.750 xuống còn 1.550 chỉ tiêu; Y-Dược giảm từ 840, xuống còn 620. Đặc biệt, Trường Cao đẳng Kinh tế Kỹ thuật giảm từ 1.600 chỉ tiêu xuống còn 1.300 chỉ tiêu.

Năm học 2016-2017, ĐHTN bắt đầu tuyển sinh khóa học đầu tiên tại Phân hiệu ở tỉnh Lào Cai. Chỉ tiêu dự kiến tuyển là 200, thuộc các ngành Nông, Lâm nghiệp, Kinh tế, Du lịch, Ngoại ngữ. Hình thức tuyển sinh của ĐHTN vẫn áp dụng thi dựa trên kết quả kỳ thi THPT Quốc gia 2016 và xét tuyển theo kết quả học tập theo học bạ của thí sinh sau khi đã tốt nghiệp THPT. ĐHTN dự kiến vẫn tổ chức Hội đồng thi THPT Quốc gia theo hồ sơ đăng ký của thí sinh như năm 2015.